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兄弟为了寻找神秘的贤者之石而展开旅程。哥哥爱德华岁，是有史以来最年少得到国家錬金术师的资格的天才的錬金术师；弟弟阿尔丰斯虽然拥有威武的铠甲姿态，但却是位善良的岁少年。
二人来到东部边境市镇里奥尔，在那里，他们目睹了称为太阳神雷特代理人的柯奈罗主教的奇迹之业
艾尔林克兄弟与....主教在雷特教会的秘密地下室为争夺贤者之石而决战，但就在这时候，听说主教有危险而前来的雷特信徒来到闯入干扰，艾尔林克兄弟逃到镇上，被深信柯奈罗的村民发现包围，被奇迹之技而唤醒的雷特神像打倒阿尔丰斯，爱德华被捕后再被带到柯奈罗面前
在旅途中经过的街角古书店里，爱德华和阿尔丰斯找到了錬金术的入门书，想起了以前用这书学习錬金术的时候，那时两个人还很小的时候，一起在利赞布鲁村生活的岁月，他们为了想看见妈妈的笑脸，为了这心情，竞争着修练錬金术...
艾尔林克兄弟为了成为国家錬金术，离开出生的故乡利赞布鲁展开旅程，在途中听说了有关錬金术师玛吉哈尔的传言，于是决定前往他所居住的村子，可是那村子却流传着死人接连出现袭击村民的谣言....
为了成为国家錬金术师，爱德华和阿尔丰斯向着中央进发，但在快要抵达时，却收到洛伊.马斯坦中佐的报告电话，突然命令他们坐上接着的列车，原来这列车上戴着与家人旅行中的哈克罗将军...
国家錬金术师资格试临近，在马斯·灰兹介绍下，爱德华和阿尔丰斯寄居于第一位成功做出生体錬成的
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